2015年4月3日、トヨタはピクシス・バンを一部改良し、同日から全国のトヨタカローラ店、ネッツ店および、軽自動車比率の高い地域で取扱希望のあった一部のトヨタ店、トヨペット店で発売した。
今回の一部改良では、エンジンの電子スロットル化などの燃費改善で、MT車は17.2km/L、2WD・AT車は16.2km/Lの低燃費を実現した。スペシャル“クリーンバージョン”（2WD車）は「平成27年度燃費基準＋5％」を達成し、「平成17年基準排出ガス75％低減レベル」の認定取得とあわせ、「エコカー減税」の対象となっている。
