トヨタGAZOOレーシングは2023年9月22日、GR86のルーツとなるAE86の生誕40周年を記念しGR86特別仕様車「RZ“40th Anniversary Limited”」を期間・台数限定で販売する。
この特別仕様車は、RZグレードをベースに、エクステリアは、白または赤のボディ色に限定。AE86の赤×黒・白×黒のツートーンを想起させる専用デカールを貼り、インテリアにはAE86のヒストリーを感じさせる専用ロゴ・加飾を多数特別装備している。さらに、今回の改良によりオプション設定されるブレンボ製ベンチレーテッドディスクブレーキ、ザックス（ZF）ダンパーも特別装備している。
このGR86 特別仕様車「RZ“40th Anniversary Limited”」は、全国のGR Garageを通じて、9月25日から10月9日までの期間限定で商談予約の抽選受付を行ない、2024年2月頃より200台限定販売を予定している。
また同時に、安全装備の追加設定、走行性能の向上など、GR86を一部改良し、9月22日より全国のトヨタ車両販売店にて注文を受け付け、11月1日より発売する。
GR86の改良点は、MTモデルにアイサイトを標準装備化。またステアリングホイールにハンズフリースイッチを標準装備とし、走行中のハンズフリー通話に対応している。
その他にブラインドスポットモニターをSZグレードに追加オプション設定し、RZグレードは標準装備化。そしてVSCの制御チューニングによりコーナリング時の走行安定性・安全性能向上を図っている。
また電子スロットル出力特性の変更によるコントロール性の向上も行なっている。
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