2013年8月19日、トヨタはピクシスエポックをマイナーチェンジし、全国のトヨタカローラ店、ネッツ店、軽自動車比率の高い地域で取扱希望のあった一部のトヨタ店、トヨペット店を通じて発売した。
今回のマイナーチェンジでは、低燃費・低価格をより一層追求し、2WD車で33.4km/Lという低燃費を実現し、エントリー価格を、74万5000円とリーズナブルに設定した。また衝突回避支援システム「スマートアシスト」搭載車の設定や、後続車との追突危険性を低減させるエマージェンシーストップシグナルを全車に標準装備するなど、安全装備をより充実している。
なおピクシスエポックはダイハツ・ミライースのOEM車両であり、燃費向上のための改良点などに関しては、ミライースの記事を参照。