トヨタはアイシスを一部改良するとともに特別仕様車を設定し、全国のトヨタ店を通じて、2013年10月2日に発売した。
今回の一部改良では、横滑り防止装置のVSC（Vehicle Stability Control）とトラクションコントロール（TRC）を全車標準装備した。またスポーツオプティトロンメーターの色をディープブルーにするなど、インテリアにも変更を加えている。ボディカラーは新色のダークブラウンマイカメタリックを含む全8色が設定される。
同時に追加となった特別仕様車はプラタナ V-SELECTION NoirとBlanc。プラタナをベースにV-SELECTIONの装備を追加し、外板色はブラック、ホワイトパールクリスタルシャインの2色で、それぞれコーディネイトした内外装を採用する。また、両側パワースライドドア（イージークローザー、挟み込み防止機能付）や電動格納式リモコンカラードドアミラー（サイドターンランプ付）などを特別装備している。
■トヨタ・アイシス価格表
■トヨタ・アイシス特別仕様車価格表
