2013年5月31日、トヨタはアクアを一部改良し、同日から発売を開始したと発表した。今回の一部改良では、「G」にシックな室内空間を演出した新仕様“ブラックソフトレザーセレクション”を設定している。
“ブラックソフトレザーセレクション”はブラックの合成皮革シート表皮などの採用に加え、スマートエントリー&スタートシステム、盗難防止システム、コンライトをセットにしたスマートエントリーパッケージを標準設定している。
また、「L」を除く全車に、スーパーUVカットガラス(フロントドア)、助手席バニティミラー付サンバイザーを標準装備し、助手席オープントレイやドアスイッチベースのアクセントカラーを変更するなど、室内の質感を向上させている。またウェルキャブ(メーカー完成特装車)についてもベース車と同様の改良を施している。
